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在PCR扩增实验中应注意什么
1.引物的质量是保证PCR特异性的关键,引物过长或过短均会使特异性降低,以18~30bp为宜;引物中C+G含量宜在50%左右;引物内部和引物之间不应含有互补序列;引物的碱基顺序与非扩增区域的同源性应小于70%;引物的3’末端与模板DNA一定要配对,但末端没有严格的限制,故引物设计时可在5’末端加上限制性内切酶位点和/或启动密码ATG等;引物合成后必须纯化以去除合成产物中的不完整序列、脱嘌呤产物、碱基修饰链等“杂质”;引物的终浓度一般为0.2~0.5μmol/L,过低会影响反应产量,过高会增加引物二聚或错配的几率。
2.TaqDNA聚合酶具有5’→3’聚合酶活性和5’→3’外切酶活性,但无3’-5’外切酶活性,因此对单核苷酸的错配无校正功能,发生碱基错配的几率为2.1×10-4左右。然而TaqDNA聚合酶的优势在于反应产量高于其他DNA聚合酶。Stratagene推出的PfuDNA聚合酶一直是研究人员心目中最好的高保真酶,而PfuDNA聚合酶经基因工程改造后,新创出的PfuUltra具有更佳的校验活力。数据显示PfuUltraTM高保真DNA聚合酶的平均错配率为PfuDNA聚合酶的1/3,为TaqDNA聚合酶的1/18,是目前保真度最高的PCR酶(保真度=1/错误率)(数据来源:美国冷泉港实验室)。
3.Mg2+浓度也是影响反应效率和特异性的重要因素之一。TaqDNA聚合酶对Mg2+浓度非常敏感,Mg2+可与模板DNA、引物及dNTP等的磷酸根结合,不同反应体系中应适当调整MgCl2的浓度,一般以比dNTP总浓度高出0.5~1.0mmol/L为宜,Mg2+过量能增加非特异扩增。
4.dNTP的浓度过高会增加碱基的错误掺入率,使反应特异性下降;过低则会导致反应速度下降。使用时4种dNTP必须以等当量浓度配制,均衡的dNTP有利于减少错配误差和提高使用效率。
5.温度循环参数中应特别注意复性温度,它决定引物与模板的特异性结合。退火复性温度可根据引物的长度,通过Tm=4(G+C)+2(A+T)计算得到。在Tm允许的范围内,选择较高的退火温度可大大减少引物与模板之间的非特异结合。
6.减低污染的常规措施:①将PCR试剂、PCR产物及其他分子生物学试剂分开放置;②应保持样品制备、PCR反应液配制与PCR产物分析三个工作区的独立性;③使用阳性和阴性对照;④使用最高质量的水配制PCR实验的所有反应试剂;⑤配制好的PCR反应试剂应分成小包装储存,每个包装仅用于单次实验;⑥制备样品、配制试剂及反应液时必须戴手套;⑦实验前一定要认真清洁加样器等。
实验室温湿度国家标准
实验室温湿度的国家标准是:温度范围为18℃~28℃,湿度范围为30%!RH~75%!RH,温湿度变化率不大于0.5℃/h或2.5%!RH/h,温湿度均衡性和稳定性应符合GB50179《实验室设计》的要求,温湿度日变化范围应小于±2℃和±5%!RH,空气中的污染物应小于GB/T18287-2000的要求。
实验室倒板如何操作
左手持板,右手将凉至45度左右的培养基倾注到平板内,每把约15毫升左右,培养基厚度约0.5厘米,在平板内的培养基凝固之后,倒置放在37度培养过夜,如无细菌生长即可使用。
有机合成要一直呆在实验室吗
有机合成的研究和实验通常需要在实验室中进行,因为这种研究需要使用一系列的有机化学试剂和设备,需要精确控制反应条件以及对反应产物进行分析和鉴定。虽然有机合成需要在实验室中进行,但是研究人员可以根据需要安排时间和工作计划,灵活地进行实验和研究。
同时,现代科技的发展也为有机合成的研究提供了新的可能性,研究人员可以通过计算机模拟等方式减少实验室操作的时间和数量,提高研究效率。
因此,有机合成的研究和实验虽然需要在实验室中进行,但是研究人员可以根据需要灵活安排时间和工作计划,并利用现代科技手段提高研究效率。
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